鹿港文武廟為三合一式的傳統文教祭祀空間，以文開書院居左、文祠居中、武廟居右等三個建築體組成的一大建築群，故統稱為「文武廟」。文祠、武廟的創建時間均為嘉慶16年（西元1811年），文祠是由北路理番同知薛志亮率地方士紳陳士陶捐資倡建，崇祀文昌帝君，為士子會文結社之處，鹿港的文人曾於文祠內成立「拔社」，是鹿港早期的義學與詩社；武廟由當年富紳蘇雲從倡議，同知薛志亮捐俸，由官民合資共建，供奉關聖帝君，除為鹿港眾商之守護神外，亦是地方人士義結金蘭的場所。廟宇從嘉慶16年（西元1811年）倡建，嘉慶17年（西元1812年）動工，隔年落成。嘉慶23年（西元1818年）因建築有頹圮現象，亦有需要補建之處，文祠、武廟於是進行重修並增設左右廂房，於嘉慶24年（西元1819年）完工。 道光4年（西元1824年）鹿港海防同知鄧傳安認為鹿港雖文風已盛，然非縣治所在，學子苦無就學場所，乃倡同「八郊」建立書院，其中尤以八郊首富林振嵩之子林文濬出力最多。為求早日設立書院，地方人士找到文祠左邊的空地作為書院的院址，幾經波折，直至道光7年（西元1827年）才完成，書院名為「文開書院」，係為紀念明末儒者沈光文（字文開），其於鄭氏時期來臺從事教育工作，因而被譽為「開臺文化之父」。 同治8年（西元1869年）鹿港同知孫壽銘發起重修文祠，並聘請進士蔡德芳掌教文開書院。光緒2年（西元1876年）文祠正殿因年久失修而傾頹，由董事施家珍等人募款重修，並增改二廂廊，此次重修，歷時二年餘，至光緒4年（西元1878年）完成修復。 大正元年（西元1912年）由蔡德宣發起重修文武廟，由地方紳商辜顯榮等人捐輸，秀才鄭鴻猷監督工程，此次重修工程至大正5年（西元1916年）完成。又因日治時期，北白川宮能久親王曾率軍駐紮書院，昭和18年（西元1943年）日人將文開書院改為「北白川宮能久親王紀念館」。現今龍邊廂廊內有二塊當時所立的碑記，分別為臺灣總督長谷川清所書的「北白川宮能久親王御遺跡鹿港軍情御視察之所」碑及臺中州知事森田俊介所題「北白川宮能久親王視察鹿港遺跡紀念」碑。 二戰後，文武廟成為駐軍軍營，文祠正殿由駐軍駐紮，武廟兩廂充為兵舍及彈庫，民國58年（西元1969年）重修武廟山門與正殿，民國62年（西元1973年）文祠曾進行拜亭（山門）基礎修復與武廟的修繕增建，民國64年（西元1975年）文開書院遭受回祿之災，建築、文物嚴重破壞，民國68年（西元1979年）起分期完成文祠、書院和環境修復工作，民國72年（西元1983年）文武廟遂再進行一次修復，民國74年（西元1985年）經內政部公告為第三級古蹟，後經修復後恢復文開書院的建築風貌，民國77年（西元1988年）增設文武廟圍牆。民國86年（西元1997年）隨<<文化資產保存法>>修正後，依法改列為縣定古蹟，民國88年（西元1999年）九二一地震造成文開書院、文祠及武廟再度受損，民國91年（西元2002年）再度重修，至民國94年（西元2005年）8月完成修復。