中洲輪渡站位於中洲漁港內，原本位置較偏南，靠近著名的地瓜酥，後來才遷移到現址，因為隱藏在巷子內，很少人知道中洲輪渡站的正確位置。
中洲輪渡站肩負「前鎮－中洲線」，在早期過港隧道尚未興建前，是旗津居民來往前鎮的主要航線，尤其是到前鎮加工出口區上班。在尚未有渡輪時，居民是靠搭乘民營的汽船或舢舨通行。
1973年9月3日時清晨，一艘由中洲開往前鎮的「高中六號」民營渡輪，因超載及機械失靈而翻覆，當時船上載著正要前往前鎮加工出區上班的25位未婚女性，這些住在旗津中洲地區的女性勞工全數罹難，經市政府與地方仕紳協調，決議合葬。2008年，為感念這些女性勞工為臺灣經濟成長的努力付出，將「二十五淑女墓」改名為「勞動女性紀念公園」。
1984年，過港隧道開通後，搭乘渡輪的乘客減少，因受限高危險性車輛禁行於隧道的安全規定，「前鎮－中洲線」特別開駛專船，供載運瓦斯及化學原料，以補其不足。
