二戰期間，日軍在高雄港及旗津的軍事部屬，主要集中在旗後、平和町至綠町一帶，而大汕頭以南至中洲，未有太多軍事設施，因此空襲疏開以旗後居民為主，中洲居民未被強制疏散，基本上多留在社區防空壕或沙地防風林避難。
據受訪人中洲地區郭水發先生所述，其父執輩於二戰美軍空襲時，曾於沙地上的林投樹林避彈，因而與同村女子譜出愛戀，進而發展為婚姻關係，為社區所稱道。
西元1944年(昭和19年)10月，美軍與日軍為了制空權，進行激烈的「台灣沖航空戰」，據「旗峰會采微」一書受訪人孫水連先生指出，日軍為預防美軍航艦登陸，命中洲居民挖掘三條橫跨旗津內外港的大溝，作為魚雷水艇攻擊美艦之用，但本次作戰日軍折損過多戰力，未能發揮作用，多數溝渠沙地於日後復合，多由居民占用。
