隨著進入的漢人日漸增長，原居於此的原住民生活空間即受到了壓縮，進而造成原漢衝突事件。相較於武朥灣社，龜崙社的反彈尤為激烈，康熙24年(1795年)陳瑜拓墾南靖厝(今鶯歌南靖里)遭到龜崙社族人的襲擊﹔乾隆48年(1783年)因山頂墾地與龜崙社地界模糊不清，時有漢人進入侵墾導致糾紛不斷，甚至發生砍殺事件，張必榮墾號的張家因而與龜崙社頭目有明，以契約議定雙方分界﹔乾隆年間因傳統領域被漢人逐漸開墾蠶族人心生不滿，於除夕時趁埤角庄頭人慰勞工人之際，衝入襲擊工寮，造成72人死亡，事後庄民收屍立祠七十二萬善堂，位於今丹鳳高中旁一角。以上事件可說是原漢衝突中顯目的例證，象徵著龜崙社因土地日漸遭漢人蠶食而起的反抗，也是台灣原漢衝突中的縮影，然而最終平埔族在漢人入侵的壓力下不得不接受漢化，失去原來的傳統文化。