民國42年圓山遺址展開為期10天的試掘，為圓山遺址第一次正式發掘，於民國43年，台大考古人類學系與台北市文獻委員會合作進行發掘圓山遺址。民國76年的發掘發現繩紋陶文化層，並在底層岩盤上發現若干圓洞，為人工鑿成，推測可能為圓山文化時代的房屋柱洞，民國80年，台大人類學系受民政局委託，針對中山路三十三號道路進行試掘，普遍發現繩紋陶與圓山文化層。民國81年於大鵬劇校內的探坑，發現可能是屬於先陶時代的打製石器。