2007年4月1日就任暨大附中校長的陳啓東博士，是第1位依〈暨大附中校長遴選作業要點〉遴選的校長，陳校長以「立足埔里、接軌暨大、放眼台灣、邁向國際」為願景，穩健領導，使附中成為一所偉大的學校，提供包羅萬象、兼容並蓄的多元課程，包括學術學程、數理及語文實驗班、商業專門類科、實用技能班及進修學校，讓不同優勢智慧及個別差異的學生能適性學習、發展潛能。

       陳校長上任後即爭取經費補強耐震力不足的建築物；復考量原有圖書館承載力不足，於2014年爭取到教育部國教署補助8,382萬元，加上自籌1,000萬元，新建面積達3,116㎡的圖書教學資源大樓，挑空設計新穎前衛，啟用後已成為學生最佳的學習寶庫。    

       另讓陳校長最感動的是，台北金龍扶輪社921震後扶助附中弱勢學子義舉原擬告一段落，然2010年偕同當年10名受扶助學子參加扶輪社20年社慶時，該社支助每生3,000元旅費，學生感恩回捐，扶輪社感動承諾此後仍持續扶助附中學子，雙方溫馨往來迄今，累計捐助金額已達千萬餘元。

       此外，學校1978年即成立儀隊，但遭逢921地震而中斷，陳校長上任不久回應校友期盼，復辦儀隊，讓學生展現活力熱情，成為附中最美麗的親善大使。