1999年9月21日發生芮氏規模7.3的地震，重創埔里各中小學，地震後各校處於停課狀態。在睽違校園45天的11月8日，埔里國小於八德路台糖用地的第一簡易臨時教室復課，學生穿梭在仍在施工的臨時教室間。

       陸續復課的各中、小學，為了彌補課業進度，從星期一到星期六密集上課48節。由鐵皮搭建的簡易教室，冬冷夏熱；為了降溫，有的學校在屋頂上裝上灑水器，有的則在上頭種上花草，但撐不了多久，不是曬死就是枯死。有的在屋頂上加蓋第2層，兩層間預留空間以利通風，以解決酷熱的課題。

       2002年1月14日，直到由慈濟基金會認養興建的新校園竣工，埔里國小師生才歡天喜地搬回原校址，告別兩年多來在簡易教室克難求學的時光。