郭文燿，男性，臺南人，父親為牙醫助手，母親為日治時期臺灣總督府所培養的第一批助產士。郭文燿童年時，因為擔任助產士工作的母親接受政府的派任，舉家遷往高雄內門。

戰後，郭文燿從國民小學畢業，保送高雄工業學校，並寄居在教會長老，也是親戚彭明聰家裡，因而有機會接觸基督教信仰，後在18歲那年受洗加入教會。高工畢業工作兩三年後，有感於學識不足，加上教會長老的鼓勵，1951年進入臺灣神學院就讀。神學院畢業後，郭文燿回到高雄開設教會，並認識從事醫療工作的Pasta Osborn醫師，在他鼓勵和引介下協助畢嘉士醫師所設立的高雄基督教診所，從事漢生病患照護工作。郭文燿在畢嘉士醫師的指導下，開始學習漢生病相關醫學知識與技術。在高雄診所任職期間，除固定的傳道活動外，負責漢生病檢驗與病人訪視工作。為發現新病例，使其早日接受治療，經常騎著摩托車，四處訪視病人。