賓茂國小前身有二，一為設立於明治41 年（1910 ）的「虷仔崙教育所」。大正3年（1914 ）改為台東廳太麻里地區「虷子崙公學校」，昭和13 年（1938 ）改校名為「金崙公學校」，戰後校名不改，校址不變，位於太麻里鄉。1953 年併入金峰鄉的「賓茂國民學校」。另一為設立於大正元年（1912 ）12 月1 日，隸屬於台東廳大武支廳的「雨沐番童教育所」，位於今「都飛魯溫泉」北邊，海拔約600 公尺的大武山麓。戰後改名「賓茂國民學校」，位於金山鄉（今金峰鄉）。首任校長為章博隆。1952 年校長吳提書奉命隨村遷校至現址。1953 年太麻里鄉的金崙國民學校併入本校。1968年推展國民義務教育，校名易為「台東縣立賓茂國民小學」。