在李澤藩1946的新竹師範聘書上，除了標示教員身分外，同時也兼任了訓導處幹事一職。1947-1949年接任訓導主任一職。訓導一職責任及職責重大，包含生活品德教育，養成習慣、學生安全、團體活動的課程安排等等。

管理學校軍樂隊也是其中一項，李澤藩對於音樂也有一定的涉略與喜愛，偶爾會用家中的風琴彈奏一曲外，也因為喜愛而訂做「電子留聲機」、「短波收音機」等音響設備。在管理樂隊時也曾親自指導學生吹奏小喇叭。也因此有過被家長誤會是教導音樂的老師。

1947年二二八事件發生時，擔任訓導主任一職的李澤藩，也堅守崗位。將學生統一留校管理，以降低因社會動盪對學生造成傷害的可能性。