921地震後，埔里當地的醫療單位與基層醫療連結動員十分迅速。在2003年SARS爆發大流行時，有鑑於SARS的疫情影響，2003年6月1日埔里地區為帶動社區防疫，成立了「水沙連社區防疫聯盟」。此聯盟由埔里地區超過20個基層醫療院所、當地慈善團體和非營利組織共同組成，一同為了防疫工作和社區的安全守護而努力。

「水沙連社區防疫聯盟」的宣導與防疫工作，結合地方上自發性民間組織的志工動員和醫療單位提供的專業能力。除了健康防疫的宣導與分發口罩之外，社區還設置六處體溫測量站，倡議強化居民落實量體溫的監測工作，並規劃持續的衛生教育與教育推廣活動，建造串聯社區防疫的防護網 。