斗南寒林寺，原名稱「萬人爺廟」，主祀日本領台初期抗日而犧牲的義民軍，每年農曆4月28日為該廟落成登龕紀念日，是斗南一年一度的大拜拜。據雲林縣志稿大事記所載，民國61年寒林寺年祭有10萬香客湧入，花費近千萬元。

綜合廟內沿革、雲林縣志稿宗教篇及民間傳說所述，寒林寺所祀抗日義軍的由來可能與明治35年（1902）5月日本政府於斗六、林杞埔、崁頭厝、土庫、他里霧（斗南）與下湖口等六個地方舉行「歸順典禮」（歸順式）有關。典禮結束後，日軍突然以機關槍殺害手無寸鐵的歸順者，並曝屍在石牛溪南岸（今斗南國小）附近。後來當地仕紳陳奎牛等人將義民軍骨骸收埋於寒林寺今址，並興建萬人爺祠一座。

昭和12年（1937）萬人爺祠又遭日本人拆除，骨骸被集中到今之新庄公墓掩埋。戰後，復由陳奎牛、曾清慕等人出資倡議重建新廟，並迎回骸骨，因奉地藏王菩薩為主神，乃更名為寒林寺，現廟內奉有「忠烈抗日護國殉難諸英靈」神位一座。