善修宮位於斗六市鎮東里，鄰近斗六真一寺和斗六高中，原名善修堂，原係一所鸞堂，民國41年該堂闢建武聖殿（關聖帝君）後改稱善修宮，民國51年再增建大成殿奉祀至聖先師孔子和儒家七十二先賢，因此當地人習慣稱之為「孔子廟」。

由於雲林縣並沒有清代留存的官建孔廟，長年以來並無舉辦大型祭孔釋奠典禮，若有，亦無固定場所，善修宮自然而然成為斗六及鄰近地區居民祭孔和祈求功名的主要寺廟，近年來大斗六地區四所學校（斗六高中、斗六家商、正心高中、義峰高中）的成年禮議選擇在善修宮舉行。

早年善修宮也設有中醫診所免費義診施藥，同時附設圖書館及自修室供學子自習和讀書，善修宮還有一個特殊之處，就是宮內的對聯和匾額多為黨國大老所撰，如蔣中正、陳誠、孫科、孔德成、于右任、谷正綱等人。