小西天為佛寺，寺中仍存有同治5年（1866）鄭來旺等重修建寺留下之「小西天」廟名匾。在光緒13年（1887），當地疫病流行，居民恭請張王爺鎮壓，惡疫漸告終息，遂將王爺神像暫供於小西天，自此佛道共祀。後來王爺神威顯赫，香火不絕，當地人士蔡助倡議在廟東，即東益巷之對面一帶，另建一「益安館」奉祀王爺。

日治時期明治35年（1902）4月，當地人士蔡吉由北港義民廟分祀土地公來現今小西天處建福德祠奉祀（中秋路92、94號）。又因兼收容行旅病人，孤苦殘疾者，故又名「養濟院」。此次建祠有賴地方慈善家蔡川（字培東）鼎力相助，著手募捐始克於明治37年5月（1904）完成。現寺中尚存有一塊養濟院石碑為証。

國民政府來台時，經濟困苦，小西天內雜居一些住戶，已失往昔養濟院之本意。當時主持釋修定師姑，在經濟拮据之下，以拾肆萬元索回廟旁住屋二間。民國61年增建東室二層。民國65年向國有財產局購地70坪。民國66年冬開始重建，67年始完成佛殿高二層樓，為今日之寺貌。