在520事件發生的隔天，臺灣基督長老教會總會社會服務發展委員會以及臺灣基督長老教會聯合祈禱會共同發表緊急呼籲，對於農民與學生被捕一事，表達深切的遺憾與嚴正的關切，並籲請當局立即釋放被捕的無辜學生、農民與群眾，同時要求有關當局重視40年來農民權益被忽視與剝奪的事實，徹底檢討農業政策。

同年5月31日長老教會再次對520事件發表聲明，除了對臺灣全體農民深致敬意之外，對於農民被收押遭到刑求與逼供，表達痛心與關切。同時嚴正要求司法當局公正處理520事件，勿羅織罪名，入人於罪，以及立即釋放無辜者，以彰顯公義以及消弭朝野對立。聲明中引述聖經耶利米哀歌3章35節，「天賦的人權被蹂躪，上主必關懷。」以嚴正表達民主自由為上帝所賜予的人權。

同時羅榮光牧師亦主動協助安排全台長老教會各中會組牧師團，輪流前往土城看守所探監，並鼓勵教友寫信慰藉520事件遭到羈押的農民。在一次會面中，因遭威脅利誘脅迫而做出不實自白的邱煌生說，在與牧師面會過後，我知道我要在法庭上吐實，這不是翻供，而是講出實情而已。羅榮光牧師並為邱煌生聘任辯護律師，但終不敵司法的無情與不公，邱煌生在法庭所說未被法官所採信，最後判處1年4個月的徒刑。