嘉義人。曾入選第四、六、七、八、十回臺展（1930、1932-34、1936）與第三回府展（1940）東洋畫部，畫作簽名多為「芾亭」並蓋方印，偶有落款。朱芾亭原名朱木通，早年受漢人私塾教育，詩文兼擅，亦臨摹《芥子園畫譜》學畫，成為詩書畫三絕之文人。1927年臺展開辦後，林玉山等人因有感於參展機會的重要，而集結了嘉義、臺南兩地的畫家於隔年組成「春萌畫會」，朱芾亭即為創會成員之一。1930年4月，朱、林二人邀集諸畫家舉辦第一回的試作展覽會，12月又再舉行第二回展；同年的第四回臺展，朱芾亭亦出品取景於嘉義公園的工筆寫生畫〈公園小景〉。隔年4月據《臺灣新民報》的報導，原預計以阿里山風景送件當回臺展的朱芾亭特地登山，但此回並未有入選紀錄。至1932年才以恢復水墨技法的〈雨去山色新〉重回臺展，往後在官展上皆維持此風格。1935年6月，朱芾亭前往廈門、上海、蘇州、杭州與南京進行寫生和研究，在遊歷期間另有拜訪賀天健、劉海粟等名家一說。1940年入選第三回府展後便不再有官展的出品，而畫會事務也在戰爭期間暫停。戰後初期，朱芾亭仍參與春萌畫會的活動，並有入選前三回省展的紀錄；但之後便以漢醫師為本業，直到1977年過世。