921地震後，2002至2003年，埔里鎮立圖書館分別以「愛上圖書館計畫」入選文建會（現文化部）的臺灣公共圖書館金點子改造計畫經費二期補助款共850萬元，又以「我在悅讀花園等您計畫」獲教育部補助空間與營運改善計畫經費400萬元，整合經費共1,250萬元，進行第一期書香人文空間改造，完成改善圖書館戶外入口意象、一樓閱讀花園（約200坪）、二樓童書樂園（約200坪）及三樓書香桃源（局部）等閱讀空間優質氛圍，於2004年6月重新開館服務讀者。
這一期時任埔里鎮長的馬文君也自籌配合款投入700萬元，讓埔里圖書館充實電腦等營運設備、改善廁所及梯間環境，奠立埔里圖書館美麗蛻變的書香魅力。2004年以耀眼的創新改造成果，獲教育部評鑑為全國第一「卓越獎」的公共圖書館。2006年再次獲全國第一「金圖書館獎」。
