921地震災後重建第2年，便遇到強力桃芝颱風的侵襲，颱風再次重創歷經921地震的南投，使許多原本重建中的村落又再次瓦解，且造成災區縣民罹難失蹤、房屋毀損，真是情何以堪。這樣的情況收錄於南投縣政府2001年出版之《桃芝颱風救災總報告》。
因此南投縣政府有鑑於過去地震救災經驗，在得知桃芝颱風來臨前2日下午便先依據中央氣象局發布海上、陸上颱風警報後，成立緊急應變中心及指揮中樞，希望能在第一時間掌握訊息、災害位置，並快速提供協助處理災情，避免傷害擴大。並且於災害發生後實施搶救行動、災民安置以及考量到農業、觀光損失之因應措施，甚至發函向中央請求協助。
報告中指出，當時有部分報社與媒體因未善盡事實查證責任而呈現不實的負面報導，以致民眾誤會南投縣政府的救災行動，當時縣長也出來呼籲大家應對媒體做嚴正的審視與省思，而非跟風導致社會民心不安。
