1958年6月12日第二代醫院主體建築完工，能提供良好的醫療環境予病患的照護，但是醫院第一期完工僅包含正面的主體建築，新建築後面的病房、廚房，仍是舊的建築，要等到1966年第二期完工後，整個第二代彰化基督教醫院才改建完成。

在舊的員工餐廳裡，延續1907年以後的多功能使用方式，非用餐時室內放置的桌子可以合併形成乒乓球桌，員工可以打球舒緩身心，用餐時間則分開為餐桌，每天上午八點的員工早晨祈禱聚會禮拜，則是圍聚在桌子邊上舉行，必要時也可以舉辦各種演講、講習，或頒獎會，充分發揮空間的使用效益，節約成本使用於病患身上。