手冊的第一章均是時任台北市長的馬英九〈市長愛同志〉專欄，表示自己為將競選台北市長時政見調查問券中的同志權益兌現而辦理這系列活動，認同台北市作為國際化都市也應該有相應的同志文化，並且強調校園中的同志教育需要教師和家長付出關心與理解才能避免再有性少數的學生因性別氣質和性傾向受霸凌甚至喪失生命的憾事發生。《認識同志手冊》雖在郝龍斌繼任台北市長後繼續發行，但並不延用〈市長愛同志〉的專欄名稱，篇幅則維持在65-100頁之間。

手冊的篇幅雖短小卻精悍，將同志運動的發展脈絡、著名人物、私密生活、真心創作和長期被壓抑的感受，以風趣幽默、溫柔敏銳的姿態對著汙名和成見伸出對話的手；每屆手冊均有數篇同志父母的分享接納子女自我認同的心歷路程，並羅列網路資源、相關圖書、影視給予櫃子中忐忑不安的性少數族群，認識自己不比認識他人容易。

2008年教育部亦編印《認識同志教育資源手冊》予高中和國中教師作為性別平等教育課綱的輔助資料；也在2009年分別編製《我們可以這樣教性別》給國小老師使用、《性別好好教》給國中老師使用，卻遭受保守的教師和基督教團體聯署抵制，斷章取義且衍生至2018年全國公民投票中第11案對情感教育、同志教育、性教育的拒絕；反而彰顯未成年人在校園和家庭中性別議題的處境仍堪憂。雖然台灣已然躋身世界上少數同性婚姻合法化的國家之一，但城鄉差距和不同階級的家庭能接收到的資訊有程度的差距，相信無論過了幾十年，仍然有人需要透過《認識同志手冊》幫助自己或身旁的親友不再自我懷疑中迷失方向。