《性別平等教育季刊》中提及，1999年有在關注性別教育的民間團體與教師專業社群開始舉辦「如何推動校園同志教育」的論壇，並有教師研習課程教育計畫，除了認識同志的認知學習外，也有同志義工的生命故事分享，認為同志教育的推動如何實際進行，需要更多「認識同志」的在職學習來實踐，且對於面對同志學生或同志議題的雙重標準是頗有挑戰性的。

同年3月由關注性別教育的民間團體與教師專業組成之「同志公民權推動聯盟小組」舉辦「如何推動校園同志教育」的論壇，廣邀學界、民間團體、教師組織討論。「高雄市教師會」也表態支持。在《兩性平等教育法》草案籌劃期間，以及同志教育開始被意識到的時刻，2000年4月20日屏東縣發生中學生葉永鋕的命案，迫使教育機關與立法機關正視性傾向、性別認同、性別氣質等「多元性別」的存在，教育部開始推動「性別友善校園」的概念，而《兩性平等教育法》草案也因此改為《性別平等教育法》草案。經過民間團體與學者們的努力，於2004年6月23日《性別平等教育法》經立法院三讀通過，並由總統頒布後正式實施，同志教育亦納入課程中。