綠島的先民,多從屏東小琉球島嶼遷徙而來。1803年(清嘉慶8年),屏東小琉球相思坡的先人移民來島上。綠島天后宮的開基媽祖是由林再生從小琉球奉請來到綠島當地,起初是供奉在家中,保佑綠島合境平安。直到1985年(民國74年)才建廟。天后宮主祀媽祖,同祀神明為觀音、土地公、三太子及蓮姑仙子。天后宮現在已是綠島居民的信仰中心之一,位於南寮村。
其中蓮姑仙子為真人成仙,其在世時的本名為陳麗清。1991年(民國80年)左右,在廟的左邊有一戶人家的女兒陳麗清,在正值青春年華時便因病過世。後來化為鬼魂的陳麗清,便要兩位哥哥供奉祂,但兩位哥哥都單傳,無法供奉,於是前來天后宮請示媽祖。媽祖透過其乩身表示,要求陳麗清只要停止紛擾家人,媽祖願意帶領陳麗清到廟裡修行,便能修行成仙,同享香火,同時媽祖也賜封一個法號給陳麗清,稱為「蓮姑仙子」。爾後世人便供奉蓮姑仙子神尊於天后宮前殿右側,跟隨媽祖一起修行,保祐綠島當地居民。
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