日本統治臺灣後，臺灣總督府於明治28年（1895）令持清朝所發許可證樟腦業者繼續營業並加以課稅，對未持許可證者則禁其製造樟腦，因此日治初期樟腦產業在竹山瑞竹（勞水坑）、大鞍、桶頭山區仍持續興盛。

當時因為樟腦油的價格昂貴，生產量增加後，樟腦業者為利益導致品質不佳，呈現供需失調使價格低落，後來總督府為此將樟腦業收歸官方專賣。羅東樟腦局於明治32年（1899）開局運作，臺北、林圯埔等五處樟腦局晚一個月開始運作。羅東局專事製造樟腦及樟腦油，臺北、新竹以儲存樟腦及樟腦油為主兼製造，其他三局（包含林圯埔）負責儲存樟腦及樟腦油。明治33年（1900）就實際業務將之改成臺北樟腦總局、其他支局，並於產樟區設督察所，施行「官行樟腦造林」維持原料供應。

戰後臺灣總督府專賣局改為臺灣省專賣局，樟腦專賣業務改由臺灣省專賣局鹽腦科管理。1947年鹽腦科改為「臺灣樟腦公司」，同年臺灣樟腦公司從專賣局改隸省政府建設廳；1948年臺灣樟腦公司改組樟腦局管樟腦專賣；1952年臺灣生產管理委員會裁撤樟腦局，業務由菸酒公賣局經營，樟腦局南門工廠由公賣局接管並改「樟腦煉製廠」；山地製腦及樟樹處分業務由林務局接管，原樟腦局各地區管轄業務及製腦所由相關山林接辦，因產量減少加民間要求開放，樟腦專賣於1967年終止。