清光緒21年（1895）清廷因馬關條約將臺灣主權轉移給日本，爾後日本在臺灣推行新式教育教授日語，然民間社會仍堅持文化延續的私塾教育（書房），與日人所設學校教育抗衡一時。日治明治31年（1898）臺灣總督府頒《關於書房義塾規程》規定書房義塾由南投辨務署管理。明治37年（1904）南投廳頒《關於書房義塾施行細則》對教師資格有所限定，及必需領廳所舉辦書房義塾訓練班肄業證件者，且書房義塾授課時數有限制，並大力倡公學校亦含漢文科，使民間書房教育受影響。

臺灣民眾一般生活使用契約文書與算術多以漢文為主，故日治初期書房教育在名間成重要學習場所。當時皮子寮的陳德音、廍下陳德馨於自宅設書房，新街僧人在齋堂（原址在朝聖宮後）內教漢文，萬丹楊木池、皮子寮陳高等都是當時重要的漢文老師。炭寮邱文理任漢文教師，用公餘、晚上在自宅或炭寮蔡宅等地授課，松柏坑謝大墻、李有來至下車路邱文理宅中教授漢文，李有來並在自宅中設帳教授漢文，松柏坑附近學仔底亦有魏錦枝教授漢文，吳少東從其父學習漢文，長期受聘並於自宅古厝授漢文。

同時日本公學校也聘請地方有聲望漢文教師來授課，課程相對更活潑，在日本官方不斷干涉與諸多規定下，致傳統書房教育逐漸衰落。日治昭和18年（1943）隨皇民化運動展開，日人更致力將臺灣人同化為皇民，因此臺灣總督府遂頒布廢止私塾令。