李澤藩美術館成立於1994年。李澤藩在1989年逝世後，妻子蔡配為完成先生遺願，將平房的家改建為大樓。同時力排眾議，希望將先生的畫作對公眾開放展出。在李澤藩先生逝世後的第五年這願景終於在子女、學生和朋友的協助下被落實。
李澤藩美術館館藏以李澤藩畫作為主，館藏來源除了保留於家中畫室的作品外，也有一部份是由親朋好友捐贈，其中又以長子李遠川所贈畫作佔大宗。此外，美術館也曾在經費許可的範圍內購回具象徵意義的代表作。館方會定期更換展覽主題，展覽類型可分為主題展和邀請展。在籌辦主題展時，也會因應主題分別向親友們借用珍藏的李澤藩畫作作為該次展覽的展品。
作為新竹市唯一不收門票費，開業超過20年的私人美術館。李澤藩美術館的營運經費來自於財團法人李澤藩紀念藝術教育基金會。該基金會除了支持美術館的營運外，也固定頒發李澤藩美勞教育獎學金，支持清華大學藝術與設計學系的美術人才培育。不論是藉由獎學金或是成立在地美術館的型態，都是為了在李澤藩逝世後，仍能延續李澤藩長期以來對於新竹地區美術發展關照的理念。
