北三棧考古遺址位於秀林鄉順安村，三棧溪口北岸約1.5公里，懷恩橋東北方約1公里，北三棧聚落東北側鄉道，花5道路與省道交叉口。遺址範圍為沿著臺9線往北約至里程188公里處，左右兩側的沙丘田園。在臺9線與花5公路交叉口旁的玉米田可見遭公路切破的文化層，陶片與石器裸露地表，北側香蕉、玉米田園間有零星陶片分布。文化類型為花岡山文化（距今3500至2000年）以及十三行文化普洛灣類型（距今1000至300年）。遺物的部分有陶器和石器，陶器的部分花岡山文化的有明赤褐夾砂陶、紅色素面夾砂陶；十三行文化普洛灣類型的有淡紅色夾砂拍印紋陶、紅褐色夾砂灰胎陶、紅褐色夾砂灰胎陶。石器的部分有打製石斧、打製石鋤。