上明利考古遺址位於花蓮縣萬榮鄉明利村上明利聚落西北側，長漢山東方約1150公尺偏北的東側緩坡地。聚落周遭緩坡地除雜林外，多種植檳榔等農作，於聚落西北側發現一件打製石斧，地表遺物不易發現。文化類型為中央山地類型文化，年代不詳。民國79年（1990）經劉益昌調查發現，民國93年（2004）1月2日鍾國風、宋文增進行地表調查。遺址等級共區分五個等級，分別為已定等古蹟、與已定等古蹟同等重要、重要性遺址、一般性遺址、點狀分布性遺址。此區為一般性遺址。