美崙山考古遺址範圍除了美崙山公園內，大致沿著尚志路東側美崙山西側緩坡分布，位於美崙溪左岸，花蓮站東方約1公里的獨立山丘。本遺址屬十三行文化普洛灣類型，年代距今1000至300年前，遺物有陶器、打製的石器、玉器殘件。陶片如有淡褐色灰胎拍印紋陶、紅褐色夾砂灰胎陶、暗褐色泥質陶、黃褐色灰胎夾砂陶、褐色夾砂陶等。本遺址代表十三行文化普洛灣類型，從立霧溪流域一直往南下到奇萊平原美崙溪流域。遺址等級共區分五個等級，分別為已定等古蹟、與定等古蹟同等重要、重要性遺址、一般性遺址、點狀分布性遺址。此區為花蓮的重要性遺址。