芳寮Ⅱ考古遺址位於壽豐鄉水璉村，水璉國小芳寮分校東北側約900公尺，曾姓民宅（芳寮2號）後方的緩坡果園。遺址所在緩坡地因為當初整地種植果樹，因而翻出大量石板棺，地表曾經隨處可見石板等遺物，採集到打製斧鋤形器。文化類型與年代不詳。本遺址為民國92年（2003）12月10日由鍾國風、宋文增進行地表調查時，新發現登錄的遺址。遺址等級共區分五個等級，分別為已定等古蹟、與定等古蹟同等重要、重要性遺址、一般性遺址、點狀分布性遺址。此區為一般性遺址。