萬寧考古遺址位於富里鄉萬寧村，秀姑巒溪支流阿眉溪南岸的河階緩坡面上，萬寧國小以南，臺9線東側，地名為番社的阿美族聚落南方旱田緩地面上。遺物廣泛性的分布在遺址範圍內，東側因農耕緣故，地層擾動致使遺物裸露，西側近臺九線聚落間，萬寧國小旁的檳榔園坡面亦發現陶片、石器等遺物。文化類型為靜浦文化富南類型，年代距今1500至500年。遺物有陶器和石器，陶器有鼓腹式素面紅陶、鼓腹式素面灰黑陶、有紋飾紅陶片、有紋飾灰黑陶片、陶杓把、鈕把、陶蓋等；石器的部分有打製石鋤、石片器、石杵、石刀、石鎚、石錛、帶穿砥石、磨製石器殘件、石鐲、打火石、磨製圓盤；另有石板片、有肩單石、立柱等。本遺址為重要性遺址。