楊水亭於1937年（昭和12年）出生於屏東，年少時因未能順利應屆考取大學，便在友人介紹下以高中學歷先到臺東衛生院實習，1958年（民國47年）再至鹿野衛生所服務，半年後正式取得衛生單位公務員資格。隨後於1964年和來自南投的張秀絲結婚，婚後育有3女1男。
1960年代（民國50年代）成功鎮漁業發達，他曾經以獨資或合夥的方式經營過5艘漁船；也曾轉投資山坡地開墾，但之後因為風災將心血毀於一旦。1972年（民國61年）受時任新港區漁會理事長李來傳賞識，楊水亭擔任漁會的生活課長，負責當時的漁民保險。以前成功的漁民保險大概只有一百多人參加，他上任後，將漁保繳費方式改為從漁船上的漁獲公款上扣除，這種間接繳納的方式讓漁民們接受度大增，參加漁保的人數大增至兩千三百多人，這些漁民在退休後都能順利請領老年給付，讓楊水亭受到眾多漁民的感謝。
楊水亭熱衷於鎮上事務，對政治也十分具有熱忱，退休後曾擔任臺東縣漁民權益促進會理事長四處奔波替漁民爭取權益及福利，讓這位異鄉人受到成功許多漁民的敬重。
