清代宜蘭城中原各有供奉觀音娘娘、土地公、註生娘娘的廟宇。1914年(大正3年)日本人推動「宜蘭市街改正」三間廟被迫合為一廟，稱為「三興廟」。民國70年代南館市場改建，原廟基地納入南館市場改建，經市公所協調將南興廟從民生路與南興街口，遷移到南館市場大樓五樓天台上。

南興廟是舊城南門的信仰中心，祭祀註生娘娘會選擇百合花，若想求男時用白百合，求女時用紅百合，註生娘娘位於正殿中央處，左手執簿本，右手執筆，象徵其記錄民間家家戶戶子嗣，花公、花婆、十二婆姐，位於正殿右前方，花公、花婆一般象徵兒童守護神，婆祖則是輔佐註生娘娘保佑婦女護產安胎，或分所送子嗣之任務。每當求子成功、小孩滿月，信眾就會準備油飯和麻油雞酒，到廟裡還願。