位於臺東市建業里康定街，靠近知本里的慈雲寺，係由創始人釋鏡心於1961年（民國50年）間提供家產作為精舍而建。創始人在1974年（民國63年）過世後，改由圓性法師接管，沒多久轉由天慧法師擔任住持，這段期間慈雲寺從原來的小房舍改建成兩層民宅式的寺廟格局。

天慧法師後來邀請南投慈光山釋聖開法師接管寺務，讓慈雲寺正式納入南投魚池鄉慈光山系統。現有外貼白磚、三層樓公寓式佛寺的建築，即是在釋聖開法師主導下斥資興建，從1993年（民國82年）動工，至1995年（民國84年）完工舉行開光典禮，其中一樓地藏殿開放外界存放靈骨。

慈雲寺主祀阿彌陀佛、大勢至菩薩、觀世音菩薩等神明，主要祭典活動包括佛祖誕辰及地藏法會，信徒大多來自於知本、臺東市區等地民眾。