921地震時，醒靈寺也損毀不少，廟宇有經過重建。醒靈寺位在愛蘭台地東側，居高臨下，可眺望埔里群盆地及南港溪和愛蘭橋，廟宇庭園內有假山流水小橋涼亭，是賞景休閒的好地方，也是當地的信仰中心。醒靈寺為鸞堂寺廟，主祀神為三恩主──關聖帝君、孚佑帝君、司命真君，是屬於中部扶鸞信仰的廟宇。早期鸞堂多是宣揚儒教及幫助民眾戒毒治病，在社會教化和戒鴉片菸毒起了很大的功用。根據史料紀載，醒靈寺創建於1901年，原名為「改化堂」，後來埔里發生大地震，廟宇倒塌，信眾覓地重建改為「醒化堂」，1949年才遷到現在的位置並改名為「醒靈寺」。醒靈寺除了是地方信仰中心，最為人津津樂道的是廟門口那對石獅，原是清代大埔城官衙門口的石獅，後來搬遷到這裡，至今已有140年歷史，是埔里稀有的古蹟。另外還有一對日本狛犬，則是日治時期能高神社的遺物，寺廟外林立的日式石燈，也是從能高神社移放在這裡，形成相當特殊的庭園景觀，很有歷史意義。