921地震重創埔里，震後重建工作是所有人心中的當務之急，當所有的重心放在重建時，新的醫院大樓、新的校舍建築陸續興建，大規模的挖掘及建築工事，往往也會在不察的情況下，拆掉古老的建築，或毀壞珍貴的文物，或破壞重要的歷史遺跡，因此921地震之後，除了災區重建，保存與搶救珍貴的文化資產也是非常重要的。

大馬璘文化遺址於1900年被日人鳥居龍藏發現，位置大約分布在現在愛蘭台地的埔里基督教醫院、暨大附中、醒靈寺一帶。「大馬璘」是舊地名。

大馬璘遺址的出土讓我們對史前時代台灣東西部族群的遷移和生活方式有所了解，文化內涵呈現多元，具有獨特性及代表性，因此學界特別稱它為「大馬璘文化」。此遺址面積範圍廣大，但是921地震後歷經諸多重建工程，遺址上蓋了許多建物，部分文化層已遭破壞。

2008年梅村社區有塊軍營拆除後的土地，縣府原本打算在此蓋射箭訓練中心，動工之後發現地下遺跡，經文史工作者簡史朗通報遺址遭破壞，工程停止，南投縣政府於是委託中研院再度進行考古挖掘研究，發現大量石器、陶器、石棺等珍貴的文化遺產，於是規劃在原地建立「大馬璘遺址文化園區」。園區在2018年完工，保留了完整考古地層，現地展示，並發揮教育功能。