骨宗事件，又作「水沙連事件」或「水沙連之亂」，康熙年間，水沙連諸社就有與漢人接觸設立「通事」，服從清朝的統治繳納番餉，後來1721年爆發朱一貴事件，水沙連諸社趁亂殺掉橫征暴斂的通事，順勢脫離漢人掌握，從「熟番」復歸不受清國管理的「生番」。

雍正年間的臺灣，鹿皮產量大量減少，年產量只剩9,000張，遠不及荷蘭、明鄭時代3萬張的年產量，鹿皮再也無法成為國際出口商品的主力。故雍正年間大量引渡閩粵等漢人來臺，致力將荒原開闢成農田阡陌，原本棲息梅花鹿的林場遭到破壞，臺灣經濟、族群、產業結構面臨劇烈轉捩。

雍正3年(1725)，大量移民往內山區域侵墾伐木（軍艦製作所需），水沙連諸社感到生存空間遭到威脅，以及課徵賦稅過重的問題，遂以首領骨宗為首，他和兒子麻思弄、水里萬領導邵族其他壯丁向平地區域（今臺中縣市、彰化縣一帶）的漢人發動長達一年獵首行動。

雍正4年(1726)清國朝廷決定武力征討，結果清廷動員官兵、從廈門調兵、民壯及熟番共2,120人，熟番即佔930人，攻進蛤仔難社（今埔里）及水裡社（今日月潭），找到首級85顆。終結骨宗事件，擒獲水裡社頭目骨宗父子及其同黨，最後骨宗等為首份子被斬首或終身監禁，結束此一事件。

骨宗事件對邵族而言是由盛轉衰的關鍵，後清國設立「水沙連堡」，以武力禁絕邵族「出草」割取頭顱的習俗；在清國政府運作下，此後漢人的墾拓活動較順利，邵族反而成為拓墾漢人的保鑣，即隘勇線的「隘丁」，也使其漸漸地漢化，致其人數越來越少，其在今日不到1,000多人。