鹿谷鄉鳳凰村鳳凰山寺的廟史記載者：「清康熙年間，莊姓先祖率其同夥數十人，由福建渡海來臺至頂城庄……，故乃結草為廬，開荒墾拓，並安奉隨隊攜帶之慚愧祖師香火以為守護神，設座禮拜。」
位於大水窟頂城聚落主祀慚愧祖師爺的鳳凰山寺廟史載嘉慶年間有閩籍客家人莊阿昧奉請慚愧祖師公香火至此開拓，續來者形成頂城、二城、溪底城、下子等聚落。此地鄰鳳凰山區，原住民出沒無常，聚落四周以土城防禦。莊姓原將慚愧祖師祀於家宅正廳，庄人凡有疑難雜症皆至求，後乃捐出 宅地就原址設置公廟，成為大水窟地區共祀神明。
鳳凰山山後時有原住民出入，光緒元年(1875)臺灣鎮吳光亮由新寮開路至此通往臺東州後山，於八通關古道的山石上雕刻「萬年亨衢」四字，祈求當地祖師公護佑軍民順利打通鳳凰山區道路。光緒2年(1876)路成，弟光忠獻「佑我開山」與鳳凰山寺，中路順利完工開通後，吳光亮有修廟之議，然因職務調動而無成。開山撫番工程增加就業機會，同時國家力量導入，原住民勢力消退，往來商旅促進地方繁榮，均有熬腦寮灶。所產大竹，可以編筏、蓋屋、製紙；筍則製以為脯，民賴其利。
1970年代鹿谷茶業、觀光業發展及鳳凰鳥園設立，觀光休閒來往人潮日益增加，地方經濟再度繁榮。
