新寮靈鳳廟為鹿谷鄉的十大寺廟，慚愧祖師公為廟裡的主祀神祇，據廟史記載，恩主邱國順道號叫「老媽符」，於乾隆22年(1757)來臺，並奉請一尊慚愧祖師金像，初來時暫奉關帝廳，後來到神寮（今新寮）搭蓋一座草寮來安置，今廟內仍奉邱國順長生祿位。

乾隆52年(1787)老媽符在小半天開墾時，適因林爽文抗清，他背著祖師金像躲避戰亂，待戰爭平息後，才回到神寮建「靈鳳廟」，因而得以保存至今。

當年9歲被阿嬤養大，今已超過78歲的廟祝盧潘德述說，該廟功蹟事錄記載：「當年祖師非常靈驗，信徒日增，各地前來迎請求問者甚眾，首由關帝廳弟子求請，後來到了草鞋芚（今草屯）行醫救世，也曾迎至新竹、臺北等地。」

最為有名的傳說是慚愧祖師最後被臺北淡水呂則文請至家中，呂則文有感於祖師靈驗，故將祖師金像藏在大櫃之中，致金身離開多年，幸而老媽符精通神術，請壇懇求祖師金身返廟，值呂家小兒腹痛，呂某故請出祖師金身求問，祖師出乩言道「欲坐輪轎」，呂某不疑將金像請上轎，突然輪動如飛，當晚回到靈鳳廟，當日為農曆3月16日，則眾弟子辦祭典歡迎祖師返廟，此後以「3月16日」為祖師公誕辰紀念日。

廟方今日仍供奉「犁頭」為地基主，與開疆拓土的早期農業信仰有關。