干城站前身為初音停車場(Hatsune),設立於1916年(大正5年)11月1日。戰後,於1947年(民國36年)10月6日更名為初英。1960年代(民國50年代),配合當地地名改稱南華。1989年(民國78年)3月,因地屬吉安鄉干城村,再改名為干城。干城站在日治時期曾肩負運輸木材的任務,戰後,中華紙漿廠在鄰近地區設廠,亦有一條專用側線從干城通往廠房,協助運輸紙漿原料。日後,由於乘車人數不多,交通部臺灣鐵路管理局遂決定於1994年(民國83年)4月1日裁撤該站。裁撤後,臺鐵並未拆除站房。
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