打狗為天然小港，同時是優良漁場之一，尤富名貴的烏魚，成為漁民採捕之所。在明朝海禁政策施行下，臺澎成為流民避難地，海盜、倭寇的巢穴，而打狗等沿海港澳也成為活動的地點之一。荷人入據之前曾兩次對大員、打狗進行勘察，然未發現有適合荷人船隻停泊的港灣。

荷據時期打狗在漁業方面扮演重要角色，每年漁汛期間大陸沿海漁船先至大員請照再南下打狗一帶捕魚，之後再回大員繳稅。荷人為收稅與取締非法捕魚，在哨船頭設有見張所，並派官員值勤以維公司權利。荷據中期大陸沿海漁民已在打狗搭建暫居草寮。另荷人鼓勵華人移墾，引進牛隻獎勵農耕，打狗地區則遲至永曆14年或更早已有華籍農民在此從事農耕，荷人也派遣官員在此地駐紮，就近處理事務，可見打狗已漸開闢。

荷據末期郭懷一事件、鄭成功即將攻臺等因素，打狗成為華人逃避戰亂或伺機潛回大陸的主要港澳，駐臺長官雖曾建議在打狗築城，然未獲巴達維亞所允許，最終在永曆15年臺灣終為鄭成功收復。