臺南祀典興濟宮於1662-1683年（鄭氏時期）興建，是鄭氏時期臺灣規模最大的保生大帝廟，也是唯一列入官方祀典春秋二祭的保生大帝廟。

正殿木柱是非常珍貴的古物，由周懋琦題贈，當時他的官銜是「福建前署臺灣兵備道提督學政臺灣府知府」。兩根柱聯的表現形式接近，中央是對聯本身，排成一行，字體較大，上聯為「秉筆陋元臣醫藥神靈宋史漏收方攸傳」，下聯是「熙朝修祀典馨香朔望清時合祭觀音亭」。聯語兩側各有一行小字，說明題贈此聯的緣由。

上聯右側的小字，說明北宋人吳夲的生年、籍貫等具體事蹟，在泉州府志有詳細記載。上聯左側的小字，則記載1684年（清康熙23年）瘴癘四起，地方人士希望素來「以醫藥活人」的神明能幫助大眾度過病災，便在廟宇的建築、神明的塑像、香火的供奉、籤詩的設立等各方面投入更多心力。下聯右側的小字，紀錄同光年間，因開山撫番之役，天降疫病，許多官兵深受病痛之苦，幸好在大眾竭誠祈求之下，「疫不為癘」，化險為夷，從而使人感到神恩浩蕩、庇佑生靈的力量。下聯左側的小字則註明題贈此聯者周懋琦的官銜。