「淡水三芝九庄輪祀保生大帝」的特色之一，在於「有神無廟」的「輪祀」傳統。

由淡水、三芝地區淡水街、忠田寮、水梘頭、北新莊、草埔尾、土地公埔、埔頭、灰磘子、林子街（圭柔山）九個庄頭的居民，擲筊決定值年的「爐主」，一年一個庄頭，輪流奉祀保生大帝。每年農曆3月17日安爐大典後，保生大帝就奉祀在新的爐主家裡，每月初二、十六，九庄的居民就會聚在這裡敬拜。

於2019年（民國108年）國曆4月21日安爐的爐主厝，門內上方橫批是「四季亨通富源長」，右方上聯是「己歲呈祥千禧樂」、下聯是「亥星顯曜萬家春」，兩聯第一個字構成「己亥」，表明此處輪值奉祀年份的干支。這三句話，表達出大眾對歲時安樂、生活富泰的祈願。