921震後初期，漫天的拆屋聲及塵埃瀰漫埔里，但在斷垣殘牆上常乍見一棵棵的蕨類，不畏惡劣環境奮力生長，帶來綠意與希望。此意象，孕育了紙教堂「再生牆」的想法。

邱文傑建築師歷經7次的設計修正後，與坂茂建築師取得再生規劃案的共識。邱文傑最終的設計是以Paper Dome作為主角，而它的附屬設施是以融合在整體環境中去思考，如配角般襯托Paper Dome。從附屬設施的大棚架經過再生池，彷彿飄洋過海到台灣，才進入Paper Dome紙教堂內部。

再生池畔的再生牆上長著由「台灣蕨類之父」郭城孟老師，特地開車送來的星毛蕨，讓冰冷的水泥牆盈滿綠意生機。