國民政府遷台初期，政治局勢不穩，馬祖四鄉五島一度分屬不同的縣治單位，直到1956年（民國45年）馬祖地區成立戰地政務委員會，將東、西犬、東湧三島併入連江縣政府，因此連江縣政府也在隔年六月起辦理身分證換發作業，將46年5月31日前或前連江縣、長樂、羅源3縣所頒定的身分證、戶口名簿等予以作廢。
南竿鄉志紀載，民國42年馬祖行政公署改制為閩東北行省，東、西莒島隸屬長樂縣、南、北竿島屬連江縣，東湧島則屬羅源縣；民國45年馬祖戰地政務委員會成立，取消長樂、羅源兩縣政府，西犬、東犬與東湧3鄉併入連江縣政府管理、實施實驗戰地政務。
據連江縣政府在《馬祖日報》民國46年9月26日刊登的（四六）廉政字第三零四七號公告，身分證換發與作廢規則如下：「一、查本縣國民身分係以「中華民國國民身分證」及「福建」等字樣之多個綠色圓形圖案，排列整齊印製底版後填寫，業於本（四六）年六月一日起開始換發，按規定凡未滿六足歲兒童不發，七歲未滿十二足歲及七十歲以上老弱不貼照片，祇軋鋼印，十三歲至七十歲以下國民均貼有相片，並在照片右下角加軋雞眼釘，左下角加軋鋼印，此外每戶尚發有戶口名簿一份，茲已全部換發竣事，有效持用。二、凡（四六）年五月三十一日以前或前連江、長樂、羅源三縣所頒白底國民身分證及戶口名簿或戶口卡片，如有遺失或漏繳者，均自本（四六）年九月三十日起一律作廢。三、特此公告」。
