台中、台南、高雄縣市合併並升格直轄市，影響了社大的學區劃分與獎補助資源分配。

由於每年每縣市的教育經費比例是固定的，行政區域的變動影響了學區重新劃分，導致於部分縣市的經費需要分配給更多所學校造成供不應求的情況，打亂了個社大的規劃。縣市升格其實不只是社大受到影響，是整個教育生態都收到變動與衝擊，99 年 12 月 25 日縣市合併當日，市民正享受升格喜悅時，教育局卻面臨合併後的問題，雖然合併前有十次之協調會，90%的法規有共識，但法令一旦公布後，馬上就有新的問題產生，甚至上了媒體。