澎湖天后宮早在70至90年代間，曾先後有首創的媽祖海上出巡遶境與宗教直航等活動，轟動全台，海上遶境創舉，至今令人難忘。澎湖天后宮主委楊國夫表示，2018年農曆3月23日媽祖聖誕，廟方依往例，會在當天以祭祀等儀式來為媽祖祝禱，難得的是，當天會有來自大陸福建石獅市保生大帝前來捐贈天后宮案桌一套。
國內每年至農曆三月都會有迎媽祖的盛會，有400多年歷史的澎湖天后宮，為喚起漁民與信徒對天上聖母在海上現身救難的事蹟之記憶與漁業不景氣，早在民國75年間，首度舉辦海上遶境活動，由三媽搭船代表出巡遶境，盛況空前。由於海上的出巡遶境，困難度遠比陸地的遶境來得高，天后宮管委會未來將會評估是否再辦。楊國夫回憶說，澎湖天后宮是闔澎三大公廟中居首，也是全台最悠久的媽祖廟，供奉有大媽、二媽和三媽，都屬金面的，1986年4月19日是天上聖母400年來首度海上出巡遶境，其後接連在76、77、79、80、81、84、88年等共計8次海上遶境，遶境範圍更擴及澎湖全島各漁港海域，包括北港朝天宮、台北吉安宮、基隆與花東等20座廟宇共襄出海遶境，轟動全台。
