(主要資料來源：《溪水旁：基督教沐恩浸信會四十週年紀念刊》，財團法人臺北市中華基督教沐恩浸信會，2005年4月30日；錫安堂訪談)
民國四十九年(1960)，「松山浸信會佈道所」在饒河街口與基隆河畔設立，以國語與臺語並行的佈道方式。民國五十年(1961)，佈道所因政府計劃興建堤壩而遭到拆除，此時一方面為了擴展佈道，另一方面既然要遷堂，也就趁機將佈道所分為國語與臺語兩部份，臺語部遷至寶清街，另成立臺語佈道所，即今日浸信會錫安堂之前身，在財務上改由浸信會慕義堂支援。
隨著時代的遷移，由於大部分信徒都可以用國語溝通，再者能夠以流利臺語講道的傳道者也不多，因此，錫安堂在民國七十七年(1988)開始，漸漸以國語講道，臺語翻譯方式佈道，不再單以臺語講道。
錫安堂由於擴展的關係，在民國八十九年(2000)從寶清街舊址遷至今日南京東路新堂，原址改為傳道人宿舍。目前該會信徒人數約有30位，牧會者為韓籍的尹俊植牧師。
