北投溪的水質
臺北市政府於2013年辦理北投石自然保留區可行性評估及範圍劃設規劃時，以手持式儀器量測儀器測量北投溪溪水之水質。整體而言，北投溪的溫度、酸鹼值、導電度和總固體溶解度等數值除地熱谷外相當一致，其溫度的分布範圍落於 30-35℃。酸鹼度的範圍落於2.2-2.4之間。導電度的範圍落於4,500-5,200 ppm之間。而總固體溶解度則落於3,500-4,000µs之間。
調查水樣的採集過程為先以0.2μm的濾紙將水樣過濾，再將樣品分裝成三瓶，其中一瓶保存，一瓶用做陰離子分析，另一瓶用做陽離子分析。
陰離子分析主要分析溫泉水中的氟(F-)、氯(Cl-)、溴(Br-)、硝酸根(NO3-)、磷酸根(PO43-)和硫酸根(SO42-)等陰離子；分析結果顯示，氯及硫酸根離子的含量高於其他陰離子甚多，其中氯離子濃度為 450-550ppm，硫酸根離子濃度為680-810 ppm，而地熱谷的水樣之氯及硫酸根離子濃度皆高於1,000 ppm，前者為2,111ppm，後者為 2,942 ppm。
陽離子分析主要分析溫泉水中的鈉(Na+)、鈣(Ca2+)、鎂 (Mg2+)、鉀(K+)、鐵(Fe2+)、錳(Mn2+)、鋁(Al3+)、鉛(Pb2+)、鋇(Ba2+)和鍶 (Sr2+)等陽離子。陽離子濃度分析結果顯示，構成北投石主要的鉛元素濃度於地熱谷及第一瀧一帶含量最高，其餘地點鉛的含量則為 0.21-.053 ppm。
在發展溫泉觀光、泡湯風氣盛行的今日，許多北投溪兩旁的溫泉旅館、浴池導入硫磺谷來的白磺，加上餐廳、家庭未經處理的汙水也一起混入由地熱谷溫泉流出的青磺水質中，這些是影響北投溪的水質與生態環境之主要因素。
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