祖師廟建築，網羅當時重要匠師。前殿為廖石成所建，後殿為郭塔。木雕黃龜哩，交趾陶為陳天乞，石雕為張木成，可說是淡水民藝寶庫。

廟宇建築元素的特色還有：

1. 廟角位置有一個穿類似制服的老先生，半蹲扛廟。
2. 廟柱有象徵士農工商的石雕。
3. 傳言廟前石燈籠如龍的眼睛，龍頭面對淡水河關渡方向，恰好為大屯山與觀音山交會處，吸納河流入龍口。
4. 宇頂的交趾陶古樸風格，甚具藝術價值。
5. 木雕為三國演義、水滸傳故事。
6. 牆角有四隻蝙蝠的石雕，象徵賜福。
7. 廟內「蹟著小姑」匾額，小姑是祖師公的故鄉。