菜園早期先民於三百年前來此地就農兼捕魚，因菜園窪地土壤肥沃專供種植蔬菜，北方又有拱北山屏障減弱強大的東北季風，遠眺像一片綠油油的「菜園」，因此取名「菜園」，日據仍沿稱菜園。菜園背山面海左側鄰近興仁水庫，水庫下方就是澎湖最著名的水鳥棲地，擁有豐富的潮間帶溼地及紅樹林生態，是候鳥遷徙休息覓食的落腳處，區内綠意盎然的優美植物俯拾可見，讓人悠然於自然之中。菜園濕地早期為魚塭養殖區，魚塭停用之後，自然回復成濕地生態，一年四季吸引許多水鳥、岸鳥前來停棲，冬季甚至可以看到黑面琵鷺，是澎湖賞鳥人士最愛的地點。濕地海岸地理環境就有先天的優勢，後因菜園海上牧場觀光活動興起，加上近年菜園社區致力於社區美化工程，使得菜園社區整體更為美觀，整座海岸開發了綠地與海岸造景，連以蔚藍海景讓人心曠神怡！